Năm 1972, hai khu vực ở trung tâm Seram được chỉ định là khu bảo tồn thiên nhiên: Wae Nua (20.000 ha) và Wae Mual (17.500 ha). Sau một cuộc khảo sát vào năm 1978, một đề xuất đã được đưa ra để hợp nhất hai khu vực lại để hình thành vườn quốc gia Manusela.[6] Vườn quốc gia Manusela được thành lập năm 1997, để bảo vệ diện tích 1.890 km2, chiếm 11% diện tích đất của đảo Seram.

Một mối đe dọa lớn được đặt ra bởi nạn phá rừng, với những hợp đồng khai thác gỗ chiếm 48% rừng Seram và việc khai thác gỗ bất hợp pháp thậm chí đã được ghi nhận trong Vườn quốc gia Manusela.[1] Một mối đe dọa khác được đặt ra bởi việc buôn bán chim hoang dã bất hợp pháp, đặc biệt là nhắm vào loài vẹt mào cá hồi. Dân số của loài vẹt mào cá hồi đặc hữu hiện đang bị đe dọa nghiêm trọng do săn bắn và phá hủy môi trường sống của nó,[4] và vườn quốc gia vẫn là thành trì cuối cùng của nó.[7] Lần đầu tiên vào năm 2006, chín con vẹt đã được thả ra ngoài tự nhiên sau khi bị bắt nhốt từ một kẻ buôn lậu vào năm 2004.[8]